| 《黃帝內經》接受了我國古代唯物的氣一元論的哲學思想，將人看作整個物質世界的一部分，宇宙萬物皆是由其原初物質“氣”形成的。在“人與天地相參”、“與日月相應”的觀念指導下，將人與自然緊密地聯系在一起。
人的一切正常的生理活動和病理變化與整個自然界是息息相關的。為了進一步明確這一點，擬從以下幾方面加以闡述：
一、“氣”是宇宙萬物的本原
如同老子所說：“有物混成，先天地生。寂兮寥兮，獨立而不改，周行而不殆，可以為天下母”，“道之為物，惟恍惟惚”，“其上不皎，其下不昧”，“視之不見名曰夷，聽之不聞名曰希，搏之不得名曰微”，這都是在說構成世界的原初物質——形而上者的“道”。宋钘、尹文將這種原初物質稱之為“氣”。《黃帝內經》受這些學說的影響，也認為“氣”是宇宙萬物的本原。在天地未形成之先便有了氣，充滿太虛而運行不止，然后才生成宇宙萬物。如《天元紀大論》：“臣積（稽）考《太始天元冊》文曰：“太虛寥廓，肇基化元，萬物資始，五運終天。布氣真靈，珝統坤元，九星懸朗，七曜周旋。曰陰曰陽，曰柔曰剛，幽顯既位，寒暑弛張，生生化化，品物咸章。’”這其實是揭示天體演化及生物發生等自然法則。在宇宙形成之先，就是太虛。太虛之中充滿著本元之氣，這些氣便是天地萬物化生的開始。由于氣的運動，從此便有了星河、七曜，有了陰陽寒暑，有了萬物。陰陽五行的運動，總統著大地的運動變化和萬物的發生與發展。
二、人與自然的關系
《黃帝內經》認為人與自然息息相關，是相參相應的。自然界的運動變化無時無刻不對人體發生影響。《素問·寶命全形論》說：“人以天地之氣生，四時之法成”。這是說人和宇宙萬物一樣，是稟受天地之氣而生、按照四時的法則而生長的，所以《素問·四氣調神大論》說：“夫四時陰陽者，萬物之根本也。所以圣人春夏養陽，秋冬養陰，以從其根，故與萬物沉浮于生長之門。逆其根，則伐其本，壞其真矣。”《素問·陰陽應象大論》也說：“天有四時五行，以生長收藏，以生寒暑燥濕風；人有五臟化五氣，以生喜怒悲憂恐。”人生天地之間，人必須要依賴天地陰陽二氣的運動和滋養才能生存，正如《素問·六節藏象論》所說：“天食人以五氣，地食人以五味。五氣入鼻，藏于心肺，上使五色修明，音聲能彰。五味入口，藏于腸胃，味有所藏，以養五臟氣。氣和而生，津液相成，神乃自生。”
人體的內環境必須與自然界這個外環境相協調、相一致。這就要求人對自然要有很強的適應性。比如《靈樞·五癃津液別》說：“天暑衣厚則腠理開，故汗出。……天寒則腠理閉，氣濕不行，水下留于膀胱，則為溺與氣。”
這明顯是水液代謝方面對外環境的適應。人的脈象表現為春弦、夏洪、秋毛、冬石，同樣是由于人體氣血對春夏秋冬不同氣候變化所做出的適應性反應，以此達到與外環境的協調統一。如果人們違背了春生夏長秋收冬藏的養生之道，就有可能產生病變。如《素問·四氣調神大論》說：“逆春氣，則少陽不生，肝氣內變；逆夏氣，則太陽不長，心氣內洞；逆秋氣，則太陽不收，肺氣焦滿；逆冬氣，則少陰不藏，腎氣獨沉。”就是一日之內、日夜之間，人體也會隨天陽之氣的盛衰而相應變化。如果違反了客觀規律，也會受到損害。如《素問·生氣通天論》說：“故陽氣者，一日而主外，平旦人氣生，日中而陽氣隆，日西而陽氣已虛，氣門乃閉。是故暮而收拒，無擾筋骨，無見霧露，反此三時，形乃困薄。”
人與自然這種相參相應的關系在《黃帝內經》中是隨處可見的。無論是生理還是病理，無論是養生預防還是診斷與治療，都離不開這種理論的指導。
三、人是陰陽對立的統一體
人是陰陽對立的統一體，這在生命開始時已經決定了。《素問·生氣通天論》說：“生之本，本于陰陽。”具有生命力的父母之精相媾，也就是陰陽二氣相媾，形成了生命體。誠如《靈樞·決氣》所說：“兩神相搏，合而成形，常先身生，是謂精。”生命體形成之后，陰陽二氣存在于其中，互為存在的條件。相互聯系、相互資生、相互轉化，又相互斗爭。如《素問·陰陽應象大論》所說：“陰在內，陽之守也；陽在外，陰之使也。”《素問·生氣通天論》說：“陰者，藏精而起亟也，陽者，衛外而為固也。”這兩句話精辟地解釋了人體陰陽的對立統一關系。
從人體的組織結構上看，《黃帝內經》把人體看成是各個層次的陰陽對立統一體。《素問·金匱真言論》說：“夫言人之陰陽，則外為陽，內為陰；言人身之陰陽，則背為陽，腹為陰；言人身之臟腑中陰陽，則臟者為陰，腑者為陽……故背為陽，陰中之陽，心也；背為陽，陽中之陰，肺也；腹為陰，陰中之陰，腎也；腹為陰，陰中之至陰，脾也。”《黃帝內經》還把每一臟、每一腑再分出陰陽。從而使每一層次，無論整體與局部、組織結構與生理功能都形成陰陽的對立統一，所以說人是陰陽的對立統一體。
四、人體是肝心脾肺腎五大系統的協調統一體
《黃帝內經》所說的五臟，實際上是指以肝心脾肺腎為核心的五大系統。
以心為例：心居胸中，為陽中之太陽，通于夏氣，主神明，主血脈，心合小腸，生血、榮色，其華在面，藏脈、舍神、開竅于舌、在志為喜。在談心的生理、病理時，至少要從以上諸方面系統地加以考慮才不至于失之片面。因此可以每一臟都是一大系統，五大系統通過經絡氣血聯系在一起，構成一個統一體。這五大系統又按五行生克制化規律相互協調、資生和抑制，在相對穩態的情況下，各系統按其固有的規律從事各種生命活動。
五、《黃帝內經》的生命觀
《黃帝內經》否定超自然、超物質的上帝的存在，認識到生命現象來源于生命體自身的矛盾運動。認為陰陽二氣是萬物的胎始。《素問·陰陽應象大論》說：“陰陽者，萬物之能（讀如胎）始也。”對整個生物界，則曰：天地氣交，萬物華實；又曰：天地合氣，命之曰人。陰陽二氣是永恒運動的，其基本方式就是升降出入。《素問·六微旨大論》說：“出入廢，則神機化滅；升降息，則氣立孤危。故非出入，則無以生長壯老已；非升降則無以生長化收藏。是以生降出入，無器不有。”《黃帝內經》把精看成是構成生命體的基本物質，也是生命的原動力。《靈樞·本神》說：“生之來謂之精，兩精相搏謂之神”。在《靈樞·經脈》還描繪了胚胎生命的發展過程：“人始生，先成精，精成而腦髓生。骨為干，脈為營，筋為剛，肉為墻，皮膚堅而毛發長”。這種對生命物質屬性和胚胎發育的認識是基本正確的。
六、《黃帝內經》的形神統一觀
《黃帝內經》對于形體與精神的辯證統一關系做出了的說明，指出精神統一于形體，精神是由形體產生出來的生命運動。如《靈樞·邪氣臟腑病形》說：“十二經脈、三百六五絡，其氣血皆上于面而走空竅，其精陽氣上走于目而為睛（視），其別氣走于耳而為聽，其宗氣上出于鼻而為臭，其濁氣出于胃走唇舌而為味。”這就將視聽嗅味等感覺認為是由于氣血津液注于各孔竅而產生的生理功能。對于高級神經中樞支配的思維活動也做出了唯物主義解釋。《靈樞·本神》說：“故生之來謂之精，兩精相搏謂之神，隨神往來者謂之魂，并精出入者謂之魄。所以任物者謂之心，心之所憶謂之意，意之所存謂之志，因志而存變謂之思，因思而遠慕謂之慮，因慮而處物謂之智。”
如此描寫人的思維活動基本上是正確的。在先秦諸子中對神以及形神關系的認識，沒有哪一家比《黃帝內經》的認識更清楚、更接近科學。關于形神必須統一、必須相得的論述頗多，如《靈樞·天年》：“神氣舍心，魂魄畢具，乃成為人。”又《素問·上古天真論》：“形與神俱而盡終其天年”。如果形神不統一、不相得，人就得死。如《素問·湯液醪醴》：“形弊血盡……神不使也。”又《素問·逆調論》：“人身與志不相有，曰死。”《黃帝內經》這種形神統一觀點對我國古代哲學是有很大貢獻的。
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